I de mest avlägsna delarna av världen existerar fortfarande magi, förkroppsligad av andar från landet, himlen och allt naturligt. 

När Europas stormakter sträcker sina koloniala imperier längre och längre, kommer de oundvikligen att göra anspråk på en plats där andar fortfarande har makten ? och när de gör det kommer själva landet att slå tillbaka tillsammans med öborna som bor där. Spirit Island är ett komplext och tematiskt samarbetsspel om att försvara ditt öhem från koloniserande inkräktare. 

Spelare är olika andar i landet, var och en med sina egna unika elementära krafter. Varje tur väljer spelarna samtidigt vilka av sina kraftkort de ska spela och betalar energi för att göra det. Att använda kombinationer av kraftkort som matchar en andes elementära affiniteter kan ge gratis bonuseffekter. Snabbare krafter träder i kraft omedelbart, innan inkräktarna sprider sig och härjar, men annan magi är långsammare och kräver eftertanke och planering för att kunna användas effektivt. 

I Andefasen får andar energi och väljer hur/om de ska växa: att återta använda kraftkort, att söka efter ny kraft eller att sprida närvaro till nya områden på ön. 

The Invaders expanderar över ökartan på ett semi-förutsägbart sätt. Varje sväng utforskar de in i några länder (delar av ön); nästa tur bygger de i dessa länder och bildar bosättningar och städer. Svängen efter det härjar de där, förorar smuts till landet och attackerar alla infödda öbor som är närvarande. Öborna slår tillbaka mot inkräktarna när de blir attackerade och ger andarna lite annan hjälp, men kanske inte alltid gör det exakt som du hade hoppats. Vissa makter arbetar genom öborna och hjälper dem (t.ex.) driva ut inkräktarna eller rensa landet från smuts. 

Spelet eskalerar allt eftersom det fortskrider: andar sprider sin närvaro till nya delar av ön och letar efter nya och mer potenta krafter, medan inkräktarna intensifierar sina koloniseringsansträngningar. 

Varje tur representerar 1-3 år av alternativ historia. Vid spelstart kräver vinst att man förstör varenda bosättning och stad på spelplanen - men när du skrämmer inkräktarna mer och mer blir segern lättare: de kommer att fly även om ett antal bosättningar eller städer finns kvar. Nederlaget kommer om någon ande förstörs, om ön översvämmas av smuts eller om Invader-däcket är uttömt innan segern uppnås. 

Spelet innehåller olika motståndare att slåss mot (t.ex. en svensk gruvkoloni eller en avlägsen brittisk koloni). Varje förändring spelar på olika sätt och erbjuder olika svårighetsförstärkningar för att hålla spelet utmanande när du skaffar dig skicklighet.